فیزیوتراپی در ارتوپدی بیشتر درارتباط با بیماری ها و اختلالات عضلانی-اسکلتی(Musculoskeletal disorders) است. بعضی از مشکلات ارتوپدی که نیاز به فیزیوتراپی دارند شامل:
 * آرتروز مفاصل مختلف (به خصوص آرتروز زانو)
 *خشکی مفاصل (مثلا به علت شکستگی ها یا بی حرکتی مفاصل)
 *دررفتگی مفاصل
 *کشیدگی های عضلانی (استرین) و پیچ خوردگی مفاصل (اسپرین)
 *آسیب منیسک های زانو
 *تغییر شکل مفاصل
 *تاندونیت و بورسیت
 *تریگر پوینت (نقطه ماشه ای)
 *اختلالات ستون فقرات (مانند افزایش یا کاهش قوس کمر)
 *فتق دیسک بین مهره ای
 *تنگی کانال نخاعی
 *ناهنجاری های ستون فقرات (مانند اسکولیوز و کایفوز)
 *سندرم گیرافتادگی شانه
 *اختلالات مفصل مچ پا